两地车牌逾期未年检的处理流程如下：
内地方面：
如果车辆仍在原注册地，车主直接前往当地车管所申请年检。需携带机动车行驶证原件、有效的机动车交通事故责任强制保险单副本、有效的年度车船税纳税或者免税证明等材料。
如果车辆在异地，车主需要在原注册车管所开具委托检验通知书，同意委托现所在地车管所进行该车辆的年检。办理委托检验通知书时，要带上车主的身份证、行驶证、车辆保险资料、车船税原件复印件、异地年检申请书等去注册地车管所办理。之后，车主到现所在地车管所查询到相关的车辆委托年检信息，即可办理年检。
将车辆开到车管所指定的检测地点进行上线检测。检测合格后，持车辆检测报告单，到车管所办事大厅打印检测合格标识。
准备好身份证、驾驶证、行驶证等相关证件，前往内地交通违法处理窗口或相关部门。
接受罚款和扣分的处罚。通常逾期未年检会扣 3 分，罚款 200 元。
接受处罚：
申请年检：
香港方面（以粤港两地车牌为例）：
确认车辆状况：提前确认车辆没有任何违规和违章行为，如有则需先处理完毕，否则无法办理相关手续。
办理批文卡延期（若需要）：在粤港（或粤澳）小汽车指标有效期满前 60 天可以办理指标延期手续。申请人网上申请办理指标延期，审核通过后交费，再到广东省公安厅交通管理局办证大厅自助终端机刷卡，自助办理。
特殊情况处理：如果存在逾期未返港等特殊情况，可能需要根据具体规定缴纳罚款或保证金等。例如，逾期未返港（在内地超过 3 个月未回到香港），粤港两地车牌年审时可能需缴纳一定金额的罚款（担保金），通常是挂牌车辆市场价格的 0.9%。
两地车牌逾期未年检后，应尽快按上述流程办理相关手续，以免影响车辆的正常使用和后续的通行。具体的要求和流程可能因地区和具体情况而有所不同，建议咨询当地车管所或佳诺港车童先生以获取详细的信息和指导。